De officiële historie spreekt van de Portugese zeevaarder Diogo de Silves die de eilanden zou hebben ontdekt in 1427. Maar de archipel verscheen al in de 14e eeuw op portolaanse kaarten, de eerst bekende is de Atlas van de Medici uit 1351.
"Het is aannemelijk dat mensen zich tenminste zo'n 700 jaar daarvoor al op de eilanden hebben gevestigd, het zou dan om Vikingen gaan, maar mogelijk nog veel eerder."
Het is aannemelijk dat mensen zich tenminste zo'n 700 jaar daarvoor al op de eilanden hebben gevestigd, het zou dan om Vikingen gaan, maar mogelijk nog veel eerder. Er zijn sedimentkernen verzameld uit verschillende meren in een laag die tussen 700 en 800 na Christus werd gedateerd en daarin zijn verbindingen ontdekt die worden geassocieerd met koeien en schapen. Een toename van het aantal houtskooldeeltjes en een afname van de inheemse boompollen in diezelfde laag zouden kunnen wijzen op het vrijmaken van land voor het weiden van vee.
Archeologen hebben verder o.a. rotskunst ontdekt en mogelijk Carthaagse en megalithische structuren, die gebouwd zouden zijn volgens een georiënteerd plan, uitgelijnd met de zomerzonnewende en verwant aan structuren die ook op Sicilië, Noord-Afrika en de Canarische eilanden gevonden zijn.
Er is nader wetenschappelijk onderzoek nodig om hier uitsluitsel over te geven. Maar het suggereert in ieder geval dat er een beschaving bestond die geavanceerd genoeg was om al vrij vroeg zo ver te reizen en deze afgelegen eilanden te koloniseren.
Vanwege de kolonisten die vanaf de 15e eeuw uit Vlaanderen overkwamen, de zogenaamde flamengo's, werden de Azoren lange tijd de Vlaamse eilanden genoemd.
De eilanden zijn desondanks altijd onder Portugees bewind gebleven. Maar specifiek de molens op sommige eilanden, net als de bereiding van een bepaald soort lokale kazen op o.a. Pico en São Jorge, herinneren nog wel aan deze historie.
